vznikol na jeseň roku 1960 na pôde Slovenskej filharmónie. Pri jeho zrode bol vynikajúci huslista sliezskeho pôvodu Bohdan Warchal (1930 – 2000), ktorý stál na čele orchestra 40 rokov. Od roku 2001 orchester umelecky vedie huslista Ewald Danel. Od svojho založenia bol Slovenský komorný orchester jedným z najpopulárnejších súborov v oblasti klasickej hudby na Slovensku. Okrem pravidelných koncertov na pôde Slovenskej filharmónie každoročne usporadúva koncertné turné v rámci celého Slovenska i na zahraničných pódiách. Orchester uskutočňuje tiež mimoriadne koncertné projekty a pre slovenské publikum objavil mnohé na Slovensku neuvedené diela svetových autorov. Významnou mierou sa podieľa na uvádzaní slovenskej hudobnej tvorby, keďže od roku 2001 premiéroval viac ako sedemdesiat nových skladieb.
Mimoriadnymi koncertmi si orchester pravidelne pripomína nielen významné výročia jubilujúcich skladateľov a hudobných osobností, ale každoročne organizovaným slávnostným koncertom Hommage à Bohdal Warchal i výrazný prínos svojho zakladateľa pre slovenskú hudobnú scénu. V rámci koncertného cyklu Hudba v chrámoch dlhodobou umeleckou spoluprácou podporuje prácu profesionálnych a neprofesionálnych speváckych zborov. Z ďalšej koncertnej činnosti je dôležité spomenúť, že orchester už niekoľko rokov pokračuje v takmer dvestoročnej bratislavskej tradícii uvádzania diela J. Haydna Sedem posledných slov nášho Spasiteľa na kríži v Katedrále sv. Martina na Kvetnú nedeľu. Pokračuje tiež v pravidelnom uvádzaní Koncertov bez bariér a Koncertov bez potlesku.
V sezóne 2025/2026 si orchester pripomenul 65. výročie svojej existencie. Pri tejto príležitosti uskutočnil sériu koncertov v rámci Slovenska i v zahraničí (Česká republika, Grécko, Bulharsko). Orchestru a jeho umeleckému vedúcemu bola v roku 2026 udelená Cena Jána Cikkera. V júli 2026 uskutočnil koncertné turné do Francúzska, kde sa predstavil na festivaloch v Remeši (Flâneries Musicales de Reims) a v Compiègne (Festival des Forêts).
V sezóne 2026/2027 sa okrem vlastného abonentného cyklu Slovenský komorný orchester predstaví tiež na sérii vianočných koncertov s Bratislavským chlapčenským zborom a vystúpi vo viacerých mestách Slovenska. Na festivale Bratislavské hudobné slávnosti bude sólistom ich koncertu Leonidas Kavakos, jeden z najvýznamnejších huslistov súčasnosti, ktorý vzdá hold 270. výročiu narodenia W. A. Mozarta uvedením jeho Husľového koncertu č. 5 A dur a tiež Koncertantnej symfónie Es dur (spoločne s gréckym violistom Iliasom Livieratosom). K mimoriadnym udalostiam nadchádzajúcej sezóny bude patriť koncert k životnému jubileu umeleckého vedúceho orchestra Ewalda Danela, koncert v Spoločenskom dome Nivy, kde SKO v roku 1961 uskutočnilo svoje historicky prvé verejné vystúpenie, a tiež opätovné uvedenie projektu Biblia v Divadle Aréna pri príležitosti 80. narodenín herca Juraja Kukuru.